Chromosome 1 - integrated map dated 3 June 99

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Sequenced clone Accession number Lab Gaps and tiling paths Molecular marker (type) RI map location (cM) Meinke map: Cloned genes and location (cM) Altmann contig Wash U contig
T25K16 AC007323 SPP   telomere     1 1101
T7I23 U89959 SPP   nT7I23 (SSLP)   CER1 (1 cM)
FUS5 (5cM)		 1 1101
      ~1 BAC       1  
F10O3 AC006550 SPP         1 1101
F15K9 AC005278 SPP         1 1101
F21B7 AC002560 SPP   nF21B7 (SSLP)     1 1101
F21M11 AC003027 SPP         1 1101
F20D22 AC002411 SPP   nF20D22 (SSLP)     1 1101
F19P19 AC000104 SPP   nF19P19 (SSLP) ~4.0 AXR3 (11 cM) 1 1101
T1G11 AC002376 SPP   nT1G11 (SSLP)     1 1101, 880
F13M7 AC004809 SPP         1 880
T7A14 AC005322 SPP   AthEAT1 (SSLP) ~1.8   1 880
YUP8H12 AC000098 SPP   m488 (RFLP) ~5.6 AXR1 (12 cM) 1 880
T25N20 AC005106 SPP         1 880
F3F20 AC007153 SPP         1 880
      ~2 BACs   ~5.7   1  
F12K11 AC007592 SPP         1 880
      ~2 BACs   ~5.7   1  
T27G7 AC006932 SPP         1 757
F22O13 AC003981 SPP   cSOD (RFLP) ~8.6 KNOLLE 1 757
F7G19 AC000106 SPP   nF7G19 (SSLP) ~8.8   1 757
T12M4 AC003114 SPP         1 757
T31J12 AC006416 SPP         1 757
F14J9 AC003970 SPP   PHYA (CAPS) ~9.2 PHYA (16 cM) 1 757
F21M12 AC000132 SPP   nF21M12 (SSLP)
nga63 (SSLP)		 ~9.3
~9.4		   1 757
T27I1 AC004122 SPP         1 757
F14N23 AC005489 SPP         1 757
T10O24 AC007067 SPP         1 757
      1 BAC       1 757
T16B5 AC007354 TIGR         1 757
T19D16 U95973 TIGR         1 757
T28P6 AC007259 SPP         1 757
      1 BAC       1 757
F25C20 AC007296 SPP         1 757
F12F1 AC002131 SPP   NCC1 (CAPS) ~10.5 CHL1 (14 cM) 1 757
      ~3 BACs       1  
F3F19 AC007357 SPP         1 6
      ~2 BACs       1  
F7A19 AC007576 SPP         1 6
      ~3 BACs       1  
F10B6 AC006917 SPP         1 6
      ~2 BACs       1  
F3O9 AC0063411 SPP         1 974
      ~4 BACs   ~21.5   1  
F20D23 AC007651 SPP         1 974
      ? BACs       GAP  
      >14 BACs       2  
F9H16 AC007369 SPP     ~26.0   2 794
      ~6 BACs       2  
F12K18 AC006551 SPP     ~26.0   2 794
T22J18 AC003979 SPP         2 794
F19G10 AF000657 SPP   nF19G10 (SSLP)
m235 (CAPS)		 ~31.9   2 794
T26J12 AC002311 SPP         2 794
F26F24 AC005292 SPP         2 794
    SPP F28C11       2  
F5O8 AC005990 SPP     ~34.7   2 794
T23E23 AC002423 SPP         2 794, 101
F3I6 AC002396 SPP         2 101
F21J9 AC000103 SPP   nF21J9 (SSLP) ~35.2   2 101
F5A9 AC004133 SPP   ZFPG (SSLP)     2 101
      ~3 BACs       2  
T24P13 AC006535 SPP         2 101
T2P11 AC005508 SPP         2 101
T7N9 AC000348 SPP   mi192 (RFLP) ~39.0   2 101
F17L21 AC004557 SPP         2 101
T17H3 AC005916 SPP         2 101
      ~4 BACs       2  
F1K23 AC007508 SPP         2 101
      ~8 BACs       2  
T5I8 AC007060 SPP   S0392 (SSLP) ~44.6   2 782
T17H7 AC004135 SPP         2 782
F17F8 AC000107 SPP   UFO (CAPS) ~47.5   2 782
F28K20 AC004793 SPP         2 782
T19E23 AC007654 SPP         2 782
      ~4 BACs       2  
F9L11 AC006424 SPP         2 765
      ~3 BACs       2  
F23M19 AC007454 SPP   mi63 (RFLP)     2 765
      ~9 BACs   ~54.6   2  
F5J5 AC006228 SPP         2 920
      ~4 BACs   ~56.7   2  
F28L22 AC007505 SPP         2 920
      ~2 BACs       2  
      ? BACs       GAP  
F9D18 AC007183 SPP         3 718
      ~2 BACs       3  
F7F22 AC007534 SPP         3 718
      ~2 BACs       3  
        GAPB (CAPS) ~59.1   3  
F1I21 AC005687 CWA         3 718
T10P12 AC007203 SPP         3 718
      ~1 BACs       3  
F28H19 AC006423 SPP   mi72 (RFLP) ~61.5   3 718
      ~2 BACs       3  
      ? BACs       GAP  
      ~6 BACs          
      ? BACs       GAP  
      ~7 BACs   ~70.9   4  
F16N3 AC007519 SPP         4 766, 979
      ~5 BACs   ~70.9   4  
F13F21 AC007504 SPP         4 766, 979
      ~2 BACs   ~70.9   4  
    SPP F23H24       4  
F11M15 AC006085 SPP         4 766, 979
      ~3 BACs       4  
F5F19 AC006216 SPP         4 762
    SPP F6D8       4  
      ~7 BACs       4  
F15I1 AC006577 SPP         4 1081
F20D21 AC005287 SPP         4 1081
T22H22 AC005388 SPP         4 1081
    SPP F28H24       4  
      ~1 BAC nga128 (SSLP) ~81.4   4  
T5A14 AC005223 SPP   mi209 (RFLP) ~81.2   4 1081
F20N2 AC002328 SPP         4 1081
F14J16 AC002304 SPP   nga280 (SSLP),
mi303 (RFLP)		 ~81.4
~81.7		   4 1081
      ~6 BACs       4 1084
    SPP F23H11       4  
T2K10 AC005966 SPP         4 910
T13D8 AC004473 SPP         4 910
F8A5 AC002292 SPP   g4026 (CAPS),
mi408 (RFLP)		 ~84.9,
~84.3		   4 910
    SPP T7P1       4  
F11P17 AC002294 SPP   nF11P17 (SSLP) ~84.3   4 910
T1F9 AC004255 SPP         4 910
T25B24 AC005850 SPP         4 910
T13M11 AC005882 SPP         4 910
F8K4 AC004392 SPP         4 910
F19K23 AC000375 SPP   nF19K23 (SSLP) ~84.4   4 910
F24O1 AC003113 SPP         4 910
T3P18 AC005698 SPP         4 910
F23N19 AC007190 SPP         4 910
      ~7 BACs       4  
F13O11 AC006193 SPP   g11447 (CAPS)     4 813
      gap          
T23K8 AC007230 SPP         4 877
T8F5 AC004512 SPP         4 877
F5I14 AC001229 SPP   nF5I14 (SSLP) ~90.4   4 877
F1E22 AC007234 SPP         4 784
      ~3 BACs       4  
F1O19 AC007152 SPP         4 776
F5A8 AC004146 SPP         4 776
F1N21 AC002130 SPP   mi185 (RFLP) ~98.9   4 776
T1F15 AC004393 SPP         4 776
      ~10 BACs       4 776
F20P5 AC002062 SPP   mi462 (RFLP) ~107.5   4 761
F17O7 AC003671 SPP         4 761
    SPP T24F2       4  
      ~18 BACs       4  
      ~3 BACs       4  
    SPP T4O12       4  
F10A5 AC006434 SPP         4 10
T4O12 AC007396 SPP         4 10
      ~1 BAC       4  
T14N5 AC004260 SPP   ADH (CAPS) ~114.2 ADH (114 cM) 4 781
F22K20 AC002291 SPP   ADH (CAPS),
n22K20 (SSLP)		 ~114.2   4 781
      ~4 BACs       4  
T30F21 AC007260 SPP         4 1025
F9K20 AC005679 SPP         4 1025
yUP8H12 AC002986 SPP   nyUP8H12R (SSLP)     4 1025
T8K14 AC007202 SPP         4 1025
      ~3 BACs       4  
g8261 U53501 Goodman         4 1060
g17311 U53502 Goodman         4 1060
      ~1 BAC       4  

 

Last Updated on 9 June 1999
By Andrew O'Shaughnessy