Chromosome 3 - integrated map dated 3 June 99

Sequenced clone Accession number Lab Gaps and tiling paths Molecular marker (type) RI map location (cM) Meinke map: Cloned genes and location (cM) Altmann contig Wash U contig
      >20 BACs       1 764
              1 935
              1 773
      ? BACs       GAP  
      >23 BACs       2  
MBK21 AB024033 Kazusa         2 862
MGH6 AB026645 Kazusa         2 862
    Kazusa MJG9       2  
MDC11 AB024034 Kazusa         2 1049
      ~2 BACs       2  
    Kazusa MCP4       2  
MDC16 AB019229 Kazusa   nga162 (SSLP) ~21.0   2 1049
    Kazusa MAG2       2  
      ~1 BAC       2  
MLN21 AB022220 Kazusa         2 1049
    Kazusa MOA2       2  
MIE1 AB023038 Kazusa         2 1049
      ~1 BAC       2  
    Kazusa K15N2       2  
      ~1 BAC       2  
MJK13 AB022218 Kazusa         2 1049
    Kazusa MQD17       2  
MSJ11 AB017071 Kazusa         2 1049, 972
MVC8 AB026653 Kazusa         2 1049, 972
MSL1 AB012247 Kazusa         2 972, 825
MYA6 AB023046 Kazusa         2 825
T2O4 AC001645 TIGR         2 825
    Kazusa MDD8       2  
MGL6 AB022217 Kazusa         2 825
    Kazusa K20I9       2  
K14A17 AB026636 Kazusa         2 825
MGD8 AB022216 Kazusa         2 825
    Kazusa MTO12       2  
MKP6 AB022219 Kazusa   m228 (RFLP) ~23.4   2 825
MIG5 AB026646 Kazusa         2 825
MEB5 AB019230 Kazusa         2 825
MBG14 AB026641 Kazusa         2 825
MRC8 AB020749 Kazusa         2 825
MYF24 AB026658 Kazusa         2 825
      ~1 BACs       2  
MVE11 AB026654 Kazusa         2 825
      ~1 BAC       2  
MLD14 AB025624 Kazusa         2 864
      ~1 BAC       2  
MPN9 AB025631 Kazusa       DWF1 (26 cM) 2 817
      ~1 BAC       2  
MQC12 AB024036 Kazusa         2 817
      ~1 BAC       2  
MOE17 AB025629 Kazusa         2 797
      ~1 BAC       2  
MXL8 AB023045 Kazusa         2 797
      ~3 BACs       2  
MIL23 AB019232 Kazusa   m358 (RFLP)     2 797
MSD21 AB025634 Kazusa   m358 (RFLP)     2 797
      ~1 BAC       2  
    Kazusa MZN24       2  
MCB17 AB022215 Kazusa         2 957
      ~1 BAC          
MWI23 AB022223 Kazusa         2 957
MXC7 AB026655 Kazusa         2 957
K14B15 AB025608 Kazusa   Superman (CAPS)   SUP (35 cM) 2 913
      ~1 BAC          
MLM24 AB015474 Kazusa         2 957
    Kazusa MEE5       2  
MDB19 AB023036 Kazusa   32C9 (CAPS)     2 957
    Kazusa MYM9       2  
      ~1 BAC       2  
    Kazusa MUJ8       2  
      ~2 BACs       2  
MOB24 AB020746 Kazusa   g4711 (CAPS) ~38.0   2 791
    Kazusa K7P8       2  
      ~2 BACs       2  
MJL12 AB026647 Kazusa         2  
MWL2 AB025639 Kazusa   m433 (RFLP)     2  
      ~2 BACs       2  
MPE11 AB0230 Kazusa         2 0
MTC11 AB024038 Kazusa         2  
    Kazusa MFE16       2  
MLJ15 AB026648 Kazusa         2  
MDJ14 AB016889 Kazusa   mi178 (RFLP) ~43.7 FUS3 (41 cM) 2 1113
MOJ10 AB026649 Kazusa       FUS3 (41 cM) 2 1113
      ~2 BACs       2  
K1G2 AB024028 Kazusa         2 1113
MMJ24 AB025626 Kazusa         2 1113
MGF10 AB018114 Kazusa         2 1113
    Kazusa K16N12       2  
    Kazusa MMG15       2  
      ~1 BACs       2  
MFJ20 AB026644 Kazusa         3 934
    Kazusa MZN14       2  
      ~1 BACs       2  
K5K13 AB025615 Kazusa       AIG2 3 934
MXE2 AB018121 Kazusa   mi413 (RFLP) ~50.6   3 934
MXO21 AB026657 Kazusa         3 934
      ? BACs       GAP  
      ~5 BACs          
    Kazusa MIL15          
    Kazusa MVA11          
MQP15 AB016878 Kazusa           1
MED5 AB026642 Kazusa           1
    Kazusa MED5          
      ~2 BACs          
    Kazusa MIF6          
      ~12 BACs         714
      ~4 BACs         731
      ~2 BACs         719
      ? BACs       GAP  
    Genoscope T14K23          
    Genoscope T32A11          
    Genoscope T12K4          
    Genoscope F7P3          
    Genoscope T21C14          
    Genoscope F18P9          
      gap          
    Genoscope F24B6          
    Genoscope T5C2          
    Genoscope T18D12          
    Genoscope F22J12          
    Genoscope F23N14          
    Genoscope T28A8          
T32N15 AC002534 CWA         4 753
      ~2 BACs          
F18N11   Genoscope         4 753
      ~7 BACs          
F18L15   Genoscope         4 753
F12A12   Genoscope         4 753
T6H20   Genoscope   TOPP5 (CAPS) ~59.1   4 753
F13I12   Genoscope         4 753
T21L8   Genoscope         4 753
F1P2   Genoscope         4 753
T23J7   Genoscope         4 753
T17F15 AL049658 Genoscope         4 753
T24C20   Genoscope         4 753
T29H11 AL049659 Genoscope         4 753
      gap          
T8P19   Genoscope         4 753
T21J18   Genoscope         4 778
T2J13   Genoscope         4 778
F2K15   Genoscope         4 778
T9C5   Genoscope         4 778
    Genoscope T16K5          
    Genoscope F3A4          
    Genoscope F11C1          
    Genoscope gap          
    Genoscope T20ED23          
    Genoscope T3A5          
F18B3 AL049862 Genoscope   g19397 (CAPS)     4 778
F24M12   Genoscope         4 778
    Genoscope F26O13          
T18N14   Genoscope         4 778
    Genoscope ATEM1          
F4F15 AL049711 Genoscope         4 778
    Genoscope T25B15          
F22O6 AL050300 Genoscope         4 778
    Genoscope F3C22          
F8J2   Genoscope         4 778
    Genoscope T13I7          
      GAP          
F4P12   Genoscope   CP29 (CAPS)
AFC1 (CAPS)		 ~74.1   4 778
    Genoscope F5K20          
      GAP          
    Genoscope T13E23          
F24B22   Genoscope         4 778
T12E18   Genoscope         4 778
T14E10   Genoscope   TSA1 (CAPS) ~92.1   4 778
T5N23   Genoscope         4 778
F28P10 AL049655 Genoscope         4 778
T15C9   Genoscope   TT5 (CAPS)
PUR5 (CAPS)		     4 778
      GAP          
T26I12   Genoscope         5 793
      ~7 BACS          
    Genoscope T8H10          
F15B8 AL049660 Genoscope         5 793
    Genoscope T10K17          
      ~7 BACs          
T16L24   Genoscope         5 793
      ~2 BACs          
    Genoscope T20K12          
F2A19   Genoscope         5 793
    Genoscope F15G16          
      ~6 BACS          

 

Last Updated on 9 June 1999
By Andrew O'Shaughnessy