Chromosome 5 - integrated map dated 4 June 99

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Sequenced clone Accession number Lab Gaps and tiling paths Molecular marker (type) RI map location (cM) Meinke map: Cloned genes and location (cM) Altmann contig Wash U contig
    ESSA F7J8          
    ESSA T10O8          
    ESSA F7A7          
T20L15   ESSA         1 938
    ESSA T7H20          
T1E22   ESSA         1 938
T22P11   ESSA         1 938
F9G14   ESSA         1 938
F15A17   ESSA         1 938
MOK16 AB005240 Kazusa   g3716 (RFLP) ~7.2   1 938
    ESSA F12E4          
    ESSA F17C15          
    ESSA F8F6          
MED24 AB005235 Kazusa   m447 (RFLP)   TFL1 (2 cM) 1 938
    ESSA F21E1          
    ESSA T19N18          
    ESSA T32M21          
    ESSA T1E3          
MUK11 AB008271 Kazusa     ~11.6   1 938, 1101
MLG18 AB025625 Kazusa         1 938, 1101
MUG13 AB005245 Kazusa   nga225 (SSLP) ~11.7   1 938, 1101
K2A11 AB018111 Kazusa         1 1101
K18I23 AB010692 Kazusa         1 1101, 799
MOP10 AB005241 Kazusa   PAI2 (CAPS)   PAI1,FAD8 1 799
MJJ3 AB005237 Kazusa   ASA-1 (CAPS)
nga158 (SSLP)		 ~15.2
~15.3		   1 799
K18J17 AB017060 Kazusa         1 0
GAP     ~3 BACs       1  
MHF15 AB006700 Kazusa   m217 (RFLP) ~18.0   1 0
GAP     ~1 BAC       1  
MOJ9 AB010697 Kazusa   g3837 (RFLP) ~18.5   1 211
GAP     ~1 BAC       1  
MBK20 AB010070 Kazusa     ~20.1   1 166
MXM12 AB005249 Kazusa   N97067 (CAPS) ~20.1   1 166
GAP     ~1 BAC AthEMC (SSLP)     1  
MAH20 AB006697 Kazusa   nga249 (SSLP) ~23.1   1 166
GAP     ~1 BAC       1  
MTH16 AB020752 Kazusa         1 1007
MYH9 AB016893 Kazusa         1 1007
GAP     ~2 BACs       1 103
GAP     ? BACs       GAP  
GAP     ~3 BACs       2 261
MXC9 AB007727 Kazusa   m224 (RFLP)     2 822
GAP     ~3 BACs   ~29.1   2  
MSH12 AB006704 Kazusa         2 3
MXE10 AB011484 Kazusa         2 3
MAC12 AB005230 Kazusa   CHS1 (CAPS) ~29.1 TT4 (13 cM) 2 3
MUA22   Kazusa         2  
GAP     ~9 BACs       2  
MQK4 AB005242 Kazusa   nga106 (SSLP) ~33.3   2 0
MTG13 AB008270 Kazusa         2 858
GAP     ~1 BAC       2  
MKP11 AB005238 Kazusa   mi322 (RFLP) ~33.3   2 858
MVA3 AB006706 Kazusa   mi438 (RFLP) ~33.3   2 777
MPI7 AB011480 Kazusa         2 777
MCM23 AB015473 Kazusa   PAT1 (CAPS) ~34.0   2 777
MRG7 AB012246 Kazusa   GDH1 (RFLP) ~33.2   2 777
GAP     ~10 BACs       2  
GAP             2 828
MWD9 AB007651 Kazusa   NIT4 (CAPS) ~40.0   2 828
MQJ16 AB012244 Kazusa         2 828
MDJ22 AB006699 Kazusa   mi90 (RFLP) ~42.3   2 828
K5A21 AB024030 Kazusa   mi433 (RFLP) ~41.8   2 828
K8E10 AB025618 Kazusa         2 828
MRN17 AB005243 Kazusa         2 828
T20O7 AB026660 Kazusa         2 828
MYJ24 AB006708 Kazusa         2 828, 1182
MKD15 AB007647 Kazusa         2 828, 1182
T32G24 AB025642 Kazusa         2 828, 1182
K19M13 AB018110 Kazusa         2,3 1182, 14
MQM1 AB025633 Kazusa         3 14
MRO11 AB005244 Kazusa         3 14
MZF18 AB009056 Kazusa         3 14
MLE8 AB010696 Kazusa         3 14
K11G2 AB016883 Kazusa         3 14
MOP9 AB006701 Kazusa         3 14
K16H17 AB016884 Kazusa         3 14
T31K7 AB025641 Kazusa         3 14
K18P6 AB010068 Kazusa   nga139 (SSLP) ~54.6   3 14
MXC17 AB016881 Kazusa         3 14
F6A4 AF069716 CWA         3 14
T11H3 AC005964 CWA         3 14
F21J6 AC006259 CWA       KNAT3 3 14
F18G18 AC006258 CWA         3 14
T14C9 AC006601 CWA         3 14
F18A17 AC005405 CWA       TNY (44 cM) 3 14
T1N24 AF149413 CWA         3 14
T19G15 AC005965 CWA         3 14
F9D12 AF077407 CWA         3 14
F15L14   CWA         3  
F21E10 AF058914 CWA         3 14
F2P16 AF007270 CWA         3 14
T21B4 AF007271 CWA         3 14
F15P11   CWA         3 14
F21A20 AF007123 CWA         3 14
F15A18 AC007478 CWA         3 14
    CWA T1H16       3  
F14I23 AC007399 CWA         3 14
F15F15 AC007627 CWA         3 14
T24G3 AC006192 CWA         3 14
F26C17   CWA         3 14
T8M17   CWA         3 14
F21B23   CWA         3 14
F24J2   CWA         3 14
    CWA T21F22          
    CWA F17P24          
    CWA F4I4          
    CWA T2J8          
    CWA T21G1          
    CWA T23B4          
    CWA T8F23          
    CWA T11F5          
    CWA F18F14          
      ? BACs       GAP  
      ~4 BACs         736
      >16 BACs         716
    CWA T3J11          
    CWA T5E15          
T2L5 AF096371 CWA         4 2
T9E19 AF104920 CWA         4 2
    KAZUSA MGG23          
MSK10 AB024037 Kazusa         4 2
F7N22 AF058825 CWA         4 2
    Kazusa T13C12          
    Kazusa K3D20          
T25C13 AF080121 CWA         4 2
    Kazusa MOI20          
T26D22 AF058826 CWA         4 2
MVP2 AF025636 Kazusa         4 2
K21B8 AF025611 Kazusa         5 711
MOK9 AB015477 Kazusa         5 711
K2K18 AB023031 Kazusa         5 711
MJE4 AB013393 Kazusa         5 711
MXH1 AB011485 Kazusa         5 711
MWP19 AB020753 Kazusa         5 711
MIK22 AB005236 Kazusa   PhyC (CAPS) PhyC (SSLP)
mi137 (RFLP)		 ~70.9
~71.0		   5 711
F14A1 AB025062 Kazusa         5 711
MEE13 AB026643 Kazusa         5 711
MAB16 AB018112 Kazusa         5 711
T30G6 AB026661 Kazusa         5 711
GAP     F24C7          
F5H8 AB025605 Kazusa         6 139
MLF18 AB016877 Kazusa         6 139
K15O15 AB024026 Kazusa         6 139
MJG14 AB017068 Kazusa         6 139
GAP     ~1 BAC          
MNJ8 AB017069 Kazusa         6 139
MPA22 AB025630 Kazusa         6 139
K12B20 AB018107 Kazusa         6 139
T31G3 AB026662 Kazusa         6 139
K22F20 AB016873 Kazusa   AthSO191 (SSLP) ~78.5   6 139
GAP     ~1 BAC          
K18L3 AB012241 Kazusa         6/7 0
K19A23 AB025610 Kazusa         6/7 0
GAP     F16F17          
MXA21 AB005247 Kazusa   PR5K (RFLP) ~79.0   7 838
MSI17 AB011481 Kazusa         7 838
MXI10 AB005248 Kazusa   GRF3 (RFLP)
RBCSB (CAPS)		 ~71.0
~79.0		   7 838
MBB18 AB005231 Kazusa   m247 (RFLP) ~80.0   7 838
MKD10 AB011478 Kazusa         7 838
K15E6 AB009048 Kazusa         7 838
MXF12 AB016892 Kazusa     ~79.0   7 838
K3K3 AB010694 Kazusa         7 909
MUL8 AB009054 Kazusa         7 909
MIJ24 AB012243 Kazusa         7 945
MKM21 AB016876 Kazusa         7 945
K13H13 AB024023 Kazusa         7 945
MYH19 AB010077 Kazusa         7 945
MUD12 AB011478 Kazusa         7 945/1097
MSN9 AB010699 Kazusa         7 1097
MPO12 AB006702 Kazusa   m423 (RFLP)     7 1097
K21I16 AB017062 Kazusa         7 1097
MNF13 AB009052 Kazusa         7 1031
K1B16 AB015470 Kazusa