A short repeat element of about 320 bp is found on T13L16 from position 62571 to 62868. This element is also found in several other genomic sequences (see Table below).

Alignment of the seven sequences detailed in the above table. Flanking inverted repeats are noted. In the T13L16 sequence, there is a flanking repeat of a single A residue.

        1                                                         60
AtFCA4  GTGTGTACATATGCATAAATCATACTCCCTCTGTTTCTAAATATTTGTAGTTT.AAAATT
AtFCA5  ~~~~GTACATATGCATAAATCATACTCCCTCTGTTTCTAAATATTTGTAGTTT.AAAATT
 AtY19  ~AAACGTAAATGCAGTAAATATTATTCCCTTTATTTTTGAATATTTGTAGTTT.AAGATT
 MPO12  ~TTTACCTACTGTTGTTAAATACTCCTTCTATGTTTATGAATATTTGTAGTTTTAAGGTT
 MUP24  AAGAAATTCGATGCATAACTAATACTCCCTCTGTTTCCGAATATTTGTAGTTT.AAGGTT
  F2N1  ~~~GGGTTCAAATCTAGTAATATACTCCCTCTGTTTCATATTAGTTGTAGTTT.AAGG..
T13L16  ~AACATTGACTAGTTAATATCATACTCCCTCTGTTTCTAAATATTTGTAATTT.AAGGTT

        61                                                       120
AtFCA4  TTTGCACACAAATTAAAAAACCATACAAATCTCATTTAATTTATCTCTTTCCTAT.AAAA 
AtFCA5  TTTGCACACAAATTAAAAAACCATACAAATCTCATTTAATTTATCTCTTTCCTAT.AAAA 
 AtY19  TTTGCACACAAATTAAGAAAACATACAAATCTCATTTAATTTATCTCTTTCCTAT.AAAA 
 MPO12  TTTGCACACAAATTAAGAAAACATACAAATCTTATTTAATTTATCTTTTTTTTATAAAAA 
 MUP24  TTTGCACACAAATTAAGAAAACATATAAATCTCATTGAATTTATCTTTTTTCTAT.AAAA 
  F2N1  .TTACACACAAATTAAGAAATCATAAAAATCTCATTTAATATACCTCTTTTATAT.AAAA 
T13L16  TTTGTACACAAATTAAAAAAACATACAAATTTCATTTAATTTATTTTTTTTCTAT..AAA 

        121                                                      180
AtFCA4  ACATCATTAATTACAACTAATCCAACCAAT.AAAAAATATGATGTAAAATACAATTGGTT 
AtFCA5  ACATCATTAATTACAACTAATCCAACCAAT.AAAAAATATGATGTAAAATACAATTGGTT 
 AtY19  ACATCATTAATTACAATTAATCCAACCAATAAAAAAATCTGATATAAAATATAATTGGTT 
 MPO12  ACATCATTA.TTATAACTAATTCAACCAATTCAAAAATATGATGTAAAATATAATTGGTT 
 MUP24  ACATCATTAATTATAACCAATCCAACCAATAAAAAAATATGATATCAAATATAATTGGTT 
  F2N1  ACTTCATTTATTATAACCAATTCAACCAATAAAAAAATAGATGATTAAATATAATTGGTT 
T13L16  ATATTATTAATTATAACTAATGCAACCAATAAAAAAATATGATCTAAAATATAATTGGTT 

        181                                                      240
AtFCA4  ....................................AAAACTATTAAATACATTTAATGT
AtFCA5  ....................................AAAACTATTAAATACATTTAATGT
 AtY19  ...................................AAAAACTATTAAACACATTTAATGT
 MPO12  ...................................AAAAACTATTAAATATATTTAATGT
 MUP24  ...................................AAAAACGATTAAATACATTTAATGT
  F2N1  ...................................AAAAAATATTAAATACATTTATTAT
T13L16  TCTTTTTTTTCCGACAATCTAAAATATAATTGGTTAAAAACTGTTAAATACATTTAATAT 

        241                                                      300
AtFCA4  TTGCAT..AGAAAAGTAAAAACAACACTTATATTGAAAAAAATAAAAAACCT........
AtFCA5  TTGCAT..AGAAAAGTAAAAACAACACTTATATTGAAAAAAATAAAAAACCT........
 AtY19  TTGCAT..AGAAAAGTGAAAACAACACTTATAAT..AAAAAATAAAAAATCT........
 MPO12  TTACAT..AGAAAAGTGAACACAATACTTATATTAAAAAAAATAGAAATTTTTTAAACCA
 MUP24  TTACATAAAAAAAAGTGAAAACAACACTTATATTGAAAAAAATAAAAATCCTTTAAAATA
  F2N1  TTGCAT..AGAAAGTTGAAAACAACACTTAAATTGAAAAAAAAAAAAACC..........
T13L16  TTGCAT..AGAAAAATAAAAACAACACTTATATTGAAAAAAATAAAAAAA..........

        301                                                      360
AtFCA4  ...TTAAACTACACTTAATTAGAAACAGAGGGAGTA..ATACGGATCTACGAGAAAAATT
AtFCA5  ...TTAAACTACACTTAATTAGAAACAGAGGGAGTA..ATACGGATCTACGAGAAAAATT
 AtY19  ...TTAAATTACACTTAATTAGAAATAGAGGGAGTA.TATAACGTACGGATGTTGTTAAC
 MPO12  CACTTAACTAGAAACAAAAAAAATAATTAAAAATCAAAGTTTTTTTTAAAAAAAATTTTC
 MUP24  CACTTAAACTACACTTAATTAGAAACAGAGGGAGTA.GTACATTCTAACAAGTAACAAAT
  F2N1  ..GTTAAACTACATTTATATAGAAACAGAGGGAGTA.GTAATTTGAAAAGAATAATAATA
T13L16  .ATTTAAACTATATATAATTAAAAACAGAGGGAGTAATAGATTTTAAAAGATTTTATATA

        361        373
AtFCA4  TAGTGAAGTC~~~
AtFCA5  TAGTGAAGT~~~~
 AtY19  CTAAACACGA~~~
 MPO12  TAGACGGTCACAA
 MUP24  GTGGTACAAAATT
  F2N1  ATAAATGTT~~~~
T13L16  ATAGTATT~~~~~

written 24 Nov 97
Larry Parnell