Name TSCL retrotransposon
ID # ATR0043
Accession U65470
Copy # 0 or 1
Reference Chye ML, et al. (1997) Plant Mol. Biol. 35: 893-903
Note single-copy in ecotypes Col-0 and Col-2,
absent from ecotypes Be-0, Oy-0 and Ler-0

 

Sequence of TSCL retrotransposon

CATTTATAATCTTTTAATGGGTTCAATATAGATAATTGCTGATCCGACAATTAGTATATT
CTCGTAGTTATCACGATTCATGATGATGATGATGATGATGATTACATCATCCAATTTGTT
AGACAATTTCTATGGATGACATCTGATAAACAGAGTGAGAAGTTTGCTTAACGCGGAAAT
ATATACACTCAAGTATTTAAAGAAGATCACGCGCGGCGATTGATTAAGCGAGAACGACGC
TACAGTAAACCAAAACCAAATCTAGATCTGTGCCTCTCCGGTCACGGTGCTTCTCACCGG
TGGCCGGAGAGGGCTTCTCCCTCTTCTCCTTTCCTCTCTCTTATCTCCTCTGCCTCTCCT
TTGAAGCTCCGGTGGTGTTCAAATCTGGCTTGCTCTTCGTCTCTTGTTGGTGGTATGCGG
CGAGTGGTCACGCACGGAGCAAAGGACGTGCGGCGTGTCTCTCTCCGTTTAAGGCAGTGG
CTTTGATGAGACGACTGTAGCGGTTGTGCGGCTCCTATCGACGGGACCATCTTCCAGATC
TGATAAATTGGTGGTGCATCGCCATGTTTCTTCAGACATCGTCGTTCTTCTTTGATTTGG
GCACAACGGTGAGTTTTCGGTGTGGCAGATCTTCTCTTCTCGGGTCTCTCTACCTGTTTT
TTCTCCAGCTCTGGTGATGGTGTGATTGATCCGACGGGCTTCTCTTGTGGAGGCAATCCA
AGGAGTCGTTTGGCTCTTGTGGATTGTTCGTGGTGGTTAGTGGCGTTGTGGGTTTTGTTT
GGTGGTCGACGTCTCTCCTCCATTGGTGGGCAGTTGAGGGTGGTAGCCTCTTCGGCCATG
GGTATGGATTCTCTGTGTCCATTGGGTTTCGTCCCTTTTGCTTCATCTCTGGTTTGCTTT
CAGGTGGAGTTTTGTTGTTCATGGTGTTGTCGGTGTTGGTTCATTTGGTGAAGGTGAGCC
TTTGGGTGTTATGGCTATGTTCACCGAGGGTTGAATAGAGGCGGCGGATAGGTCTAAGTG
GCATCACTAACTCAACGAGTTAGTGTAGAAGTCCGCGGTTGTCTTTACGTTTTTGCGTTA
GTTCTTTGAGAATCTGTAGGCACCTATCTCGAGGTTTGTGGACGGATCTCAGATAGTTGA
GCTCGTGGCAACAACGATGAGGATTCCAATACTTCGGTATTGTGGCAATCACGCAAATTT
CCAAGTTTCGCGGACTTGAAATCGGTGTTTCCCTTCGCAACTTAGTCATAATTACTCAGC
TGCAATCCGAAGTTTTTTGAGTAGTAATGTTGTTTTTAATTTTCTGTAGTGTGCTTTAAT
CCGTTCTTGTATTTTCTGTAACTTCTGTCAAAAATCTTAAAATGGTATAAAATTTAACTT
TTTACCAAAAAAAAAAAAAGTTTGCTTAACGCTTACATATGACGTATCTACGTGGATGAT
TTATGATTACAAGCTT